Нашел решение, (возможно конечно дело было в игре (хотя пробовал разные репаки), но склоняюсь что все таки в Mod menager, может у меня он как то не правильно работает, в общем до конца разбираться не стал, хотя и менял по разному структуру каталогов, изменений в игре в плане растительности так и не было. В общем удалось установить мод с помощью Nexus Mod Manager-0.63.0, если у кого то была такая беда попробуйте.

Так и не появилась зелень, цвет травы прежний, деревья увеличились но без листвы, остальное работает. Что я мог не так сделать, устанавливал через 11109_F4_Mod_Manager. И что значит в разделе установки

обязательно удалить все файлы старых версий из папки с игрой!  имеется ввиду удалить старые файлы этого мода или какие то файлы самой игры?